Grazie al contributo di sostenitori privati, la Fondazione promuove borse di studio su specifici temi di ricerca, come la natura morta o le medaglie, per studiare e indagare raccolte particolarmente significative della Fototeca e Biblioteca Zeri.
 
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Il mercato antiquariale a Milano tra XIX e XX secolo

Dottorato di ricerca, XXXIX ciclo, a.a. 2023-2025
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Guglielmo Matthiae nella Fototeca Zeri

Il nucleo 'Guglielmo Matthiae' della Fototeca Zeri: fonti iconografiche per lo studio degli scambi tra Mediterraneo orientale ed Europa in epoca medievale
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Federico Zeri e la sua eredità culturale

Assegno di ricerca 2021-2023
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Borsa di Studio Mario Scaglia 2015
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Premio Federico Zeri per lo studio e la tutela del patrimonio culturale italiano
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Borsa di Studio Chiara d'Afflitto 2012